Il est né en 1833 à Orléans et mort en 1911 à Orléans. Son père était directeur de l'entreprise de diligences "L'Orléanaise" et sa mère tenait une petite boutique d'épicerie.

Anatole Bailly rédige plusieurs manuels, grammaires et dictionnaires de grec et de latin appréciés dans les lycées français à la fin du 19ème siècle. Après la publication en 1885 du Dictionnaire étymologique latin, rédigé avec Michel Bréal, Bailly achève le Dictionnaire grec-français avec le concours d'Émile Egger. Ce dernier ouvrage assoit sa réputation scientifique. En 1911, il meurt brusquement dans sa maison natale d'Orléans.