Émile Alluard naît à Orléans le 5 octobre 1815. Ayant commencé ses études un peu tard, il est bachelier à 20 ans, mais devient maître répétiteur au Collège Royal d'Orléans et entre à l’École normale un an plus tard. Professeur de mathématiques au Collège du Havre pendant quelques mois, il revient à l’École normale comme surveillant général et y demeure plusieurs années.

En 1858 il passe l’agrégation et devient professeur suppléant de chimie à la Faculté des sciences. Il y soutient sa thèse et devient professeur titulaire de physique en 1866. Doyen de la Faculté des sciences en 1877.

Une rue d'Orléans porte son nom.